Theo quy hoạch, Khu kinh tế cửa khẩu An Giang có tổng diện tích tự nhiên là 30.729,8 ha, bao gồm 3 khu vực cửa khẩu: Vĩnh Xương 12.487 ha, Khánh Bình 8.140 ha và Tịnh Biên 10.100 ha.

Quy mô đất xây dựng tập trung tại Khu kinh tế cửa khẩu An Giang đến năm 2030 sẽ đạt khoảng 3.600 ha - 3.700 ha, trong đó: Đất xây dựng khu vực cửa khẩu (gồm các khu dịch vụ, quản lý, phi thuế quan và phụ trợ) cần khoảng 500 ha - 520 ha; đất xây dựng và phát triển đô thị khoảng 3.100 ha - 3.200 ha; đất xây dựng các khu dân cư nông thôn khoảng 2.250 ha - 2.300 ha.

Mục tiêu xây dựng Khu kinh tế cửa khẩu An Giang nhằm hình thành khu quản lý, kiểm soát cửa khẩu và khu phi thuế quan tại các cửa khẩu quốc tế Vĩnh Xương, Tịnh Biên và cửa khẩu chính Khánh Bình. Đồng thời, đảm bảo an ninh quốc phòng, tạo môi trường đầu tư thu hút các nhà đầu tư và phát triển chuỗi đô thị gồm Tân Châu, Tịnh Biên, Nhà Bàng.

Khu quản lý kiểm soát cửa khẩu được tổ chức tại 3 khu vực cửa khẩu với tổng diện tích 52,8 ha. Trong đó tại cửa khẩu quốc tế Tịnh Biên khoảng 31,5 ha, tại cửa khẩu quốc tế Vĩnh Xương khoảng 13,3 ha và tại cửa khẩu chính Khánh Bình khoảng 8 ha.

Khu phi thuế quan tại cửa khẩu quốc tế Tịnh Biên có tồng diện tích 88,5 ha, chức năng chủ yếu là thương mại dịch vụ. Khu phi thuế quan tại cửa khẩu quốc tế Vĩnh Xương có tổng diện tích 135 ha, bao gồm khu thương mại dịch vụ quy mô 85 ha và khu công nghiệp có quy mô 50 ha. Khu phi thuế quan tại cửa khẩu chính Khánh Bình có tổng diện tích 80 ha, bao gồm khu thương mại dịch vụ quy mô 40 ha và khu công nghiệp có quy mô 40 ha.

Các khu công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp có diện tích khoảng 396 ha, được phân bổ như sau: Khu vực cửa khẩu Vĩnh Xương có điện tích khoảng 134 ha, Khu vực cửa khẩu Khánh Bình có diện tích khoảng 50 ha, Khu vực cửa khẩu Tịnh Biên có diện tích khoảng 212 ha.

Ngoài 02 cửa khẩu quốc tế và 01 cửa khẩu chính, Khu kinh tế cửa khẩu An Giang còn có cửa khẩu phụ Bắc Đai tại xã Nhơn Hội (thuộc khu vực cửa khẩu Khánh Bình). Quy mô phát triển không gian (bao gồm khu quản lý kiểm soát cửa khẩu, khu thương mại dịch vụ, khu dân cư) khoảng 60 ha.